生物实验教学中心的前身是舟山师范专科学校生化系生物实验室，1998年浙江海洋学院正式批文成立基础生物实验室，2008年4月更名为生物实验教学中心，并被列入学校首批教学示范中心建设项目，2010年列入省级实验教学示范中心建设点，2013年9月通过验收正式成为省级实验教学示范中心。

中心主体现有11个基础实验分室、4个专业实验分室、2个学生创新实验室建筑面积2182M2；仪器设备台套数1210台（套）;资产总值1200万元。本中心现有专职实验管理人员5人，兼职实验教师28人，全部具有硕士以上学位，具有博士学位教师16人。

中心面向学校生物科学、生物技术、环境科学、环境工程、食品科学与工程、食品质量与安全、水产养殖、海洋资源与环境、海洋科学等9个专业开设专业基础实验课程和专业实验课程27门，开设实验项目172个年均承担实验教学工作量约为7.6万人学时数。

除承担正常实验教学任务外，中心还承担了大学生创新创业计划项目、自主性实验设计、学科竞赛等技能拓展任务。近年来，共承担了国家大创计划项目、省大学生科技创新性项目和校级科技创新性项目。指导本科学生发表论文150篇，获省级学科竞赛12项。

中心依托长江口及舟山渔场地域优势，与厦门大学、中国海洋大学合作建立了“长江口及邻近海域海洋生物与生态野外实践基地”，并正式获国家自然基金委国家基础学科人才培养基金批准，成为国家自然基金委首个海洋科学为主题野外实习基地。基地已辐射全国主要涉海高校，近2年来已有7个高校近600名学生参与了野外实践基地的实习活动，逐步形成了全国首个海上野外实习标准体系和规范，社会反响良好。中心已成为全国性的海上野外实习陆上集结地和示范基地。

以上述实践教学成果为基础，中心教师与浙江农林大学等高校合作开展了“多校联动共享共赢的产学研合作教育创新与实践”的教改研究，其相关成果获省教学成果一等奖和国家级教学成果二等奖；中心教师主持的 “海洋科技人才多元化创新教育平台建设与实践” 教改项目获得省教学成果二等奖。