黄鲫（Setipinna tenuifilis）属于鲱形目（Clupeiformes），鳀科（Engraulidae），黄鲫属（Setipinna），广泛分布于西北太平洋及印度洋沿岸海域，是中国近海渔业的主要捕捞对象。了解群体遗传结构对于有效保护和管理黄鲫种群资源非常重要。本研究利用微卫星（microsatellite）分子标记对中国沿海的黄鲫进行群体遗传学研究。研究结果近日以“Population structure and genetic diversity of hairfin anchovy (Setipinna tenuifilis) revealed by microsatellite markers”为题目发表在《Acta Oceanologica Sinica》期刊上。
研究的主要结果如下：
对中国沿海9个黄鲫地理群体共180个个体进行群体遗传学研究，结果显示黄鲫群体具有较高的遗传多样性。9个黄鲫地理群体间的遗传分化指数在0.0076~0.0515之间，且大部分FST值统计检验具有显著性。基于16个微卫星标记，STRUCTURE和PCA聚类分析的结果都表明我国沿海黄鲫从遗传组分上可分为2个群体，其中舟山以北的群体为一组群，舟山以南的群体为另一组群。分子方差分析也支持了这一结果。值得注意的是，STRUCTURE和PCA聚类分析都显示舟山样本存在混群现象，即同时存在南北两种遗传背景的个体。总体而言，基于16个微卫星标记的群体遗传学表明我国沿海黄鲫南北群体间存在显著的遗传分化和群体结构，可分为2个不同的渔业管理单元。
原文链接：https://link.springer.com/article/10.1007/s13131-024-2369-9
图1中国沿海黄鲫采样地点示意图
图2基于STRUCTURE分析的群体遗传结构
图3基于微卫星标记的黄鲫个体主成分分析（PCA）
